Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRPF1P55201 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms