Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms