Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P54278 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS2P54278 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS2P54278 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS2P54278 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS2P54278 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS2P54278 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS2P54278 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS2P54278 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P54278 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS2P54278 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P54278 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PMS2P54278 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS2P54278 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P54278 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P54278 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P54278 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms