Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RARSP54136 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RARSP54136 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RARSP54136 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARSP54136 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RARSP54136 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RARSP54136 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RARSP54136 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RARSP54136 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RARSP54136 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RARSP54136 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RARSP54136 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RARSP54136 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RARSP54136 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RARSP54136 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RARSP54136 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RARSP54136 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARSP54136 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RARSP54136 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RARSP54136 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RARSP54136 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RARSP54136 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARSP54136 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARSP54136 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RARSP54136 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RARSP54136 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RARSP54136 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RARSP54136 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RARSP54136 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RARSP54136 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RARSP54136 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RARSP54136 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RARSP54136 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RARSP54136 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RARSP54136 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RARSP54136 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARSP54136 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RARSP54136 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RARSP54136 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms