Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 REX3YLR107W 1215 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 RFA2YNL312W 822 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PDH1YPR002W 1551 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 MSC7YHR039C 1935 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YDR132CYDR132C 1488 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 ISN1YOR155C 1353 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 TOS3YGL179C 1683 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PAF1YBR279W 1338 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YRA1YDR381W 681 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PRS2YER099C 957 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PAN6YIL145C 930 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 NCE103YNL036W 666 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 MRL1YPR079W 1146 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YPR098CYPR098C 486 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 RFA1YAR007C 1866 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 ASK10YGR097W 3441 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 DBF4YDR052C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 VCX1YDL128W 1236 nt5.56□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 BSC5YNR069C 1470 nt5.56□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 FAA4YMR246W 2085 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 SRV2YNL138W 1581 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YJL193WYJL193W 1209 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YKL031WYKL031W 414 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PML1YLR016C 615 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 CAR1YPL111W 1002 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 SPO77YLR341W 1434 nt5.55□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 STL1YDR536W 1710 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 FOL1YNL256W 2475 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 STE12YHR084W 2067 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 SHM1YBR263W 1473 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 SPO7YAL009W 780 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 NMD4YLR363C 657 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 ADD37YMR184W 597 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 MED4YOR174W 855 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YPR195CYPR195C 330 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 TRK2YKR050W 2670 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 ORC5YNL261W 1440 nt5.54□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 LEU1YGL009C 2340 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PUF3YLL013C 2640 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 RMD5YDR255C 1266 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 CDC43YGL155W 1131 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 ASK1YKL052C 879 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 TIF34YMR146C 1044 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 SIS2YKR072C 1689 nt5.53□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PCL8YPL219W 1479 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 VTH1YIL173W 4650 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 VTH2YJL222W 4650 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SMF3YLR034C 1422 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 NQM1YGR043C 1002 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YKR041WYKR041W 753 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 VTA1YLR181C 993 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 UGO1YDR470C 1509 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 BUL1YMR275C 2931 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 NOT3YIL038C 2511 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 LYS21YDL131W 1323 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 GPR1YDL035C 2886 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 PCL9YDL179W 915 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 GLO2YDR272W 825 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 GLE2YER107C 1098 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SCS2YER120W 735 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 VMA16YHR026W 642 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 RPC19YNL113W 429 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SPS18YNL204C 903 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 ERI1YPL096C-A 207 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SSZ1YHR064C 1617 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 ATG32YIL146C 1590 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 NGR1YBR212W 2019 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YDR053WYDR053W 396 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 PEX7YDR142C 1128 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 LSM6YDR378C 261 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 KRE9YJL174W 831 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 XPT1YJR133W 630 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YLR283WYLR283W 945 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 PGA3YML125C 939 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SHP1YBL058W 1272 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SMA1YPL027W 738 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 GRE1YPL223C 507 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 FRE1YLR214W 2061 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 HAP1YLR256W 4509 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 ASF2YDL197C 1578 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 KCC4YCL024W 3114 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 MED2YDL005C 1296 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 ECT1YGR007W 972 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 MDY2YOL111C 639 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 OAZ1YPL052W 879 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 UTP7YER082C 1665 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 RTT103YDR289C 1230 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SCW4YGR279C 1161 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YOL035CYOL035C 303 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 PTR2YKR093W 1806 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 SEC12YNR026C 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YEL077CYEL077C 3834 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YHR182WYHR182W 2358 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 OMA1YKR087C 1038 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YLL059CYLL059C 507 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 YBL044WYBL044W 369 nt5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms