Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms