Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A1P52655 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A1P52655 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms