Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCNN1BP51168 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms