Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAMP50895 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAMP50895 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAMP50895 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAMP50895 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAMP50895 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAMP50895 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAMP50895 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAMP50895 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAMP50895 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAMP50895 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAMP50895 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCAMP50895 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCAMP50895 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCAMP50895 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCAMP50895 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAMP50895 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAMP50895 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAMP50895 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAMP50895 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAMP50895 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAMP50895 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAMP50895 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAMP50895 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCAMP50895 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCAMP50895 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCAMP50895 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAMP50895 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCAMP50895 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCAMP50895 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCAMP50895 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCAMP50895 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms