Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRE11P49959 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRE11P49959 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MRE11P49959 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRE11P49959 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRE11P49959 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MRE11P49959 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRE11P49959 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRE11P49959 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRE11P49959 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRE11P49959 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRE11P49959 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRE11P49959 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRE11P49959 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRE11P49959 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRE11P49959 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRE11P49959 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRE11P49959 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRE11P49959 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRE11P49959 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MRE11P49959 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRE11P49959 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRE11P49959 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms