Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN1P49768 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms