Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms