Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRIM1P49642 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIM1P49642 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIM1P49642 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms