Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA1P49639 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms