Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGM4P49221 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGM4P49221 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGM4P49221 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGM4P49221 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGM4P49221 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM4P49221 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM4P49221 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM4P49221 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM4P49221 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM4P49221 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM4P49221 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM4P49221 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM4P49221 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM4P49221 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM4P49221 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM4P49221 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms