Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1DP48730 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1DP48730 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms