Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIP4K2AP48426 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIP4K2AP48426 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PIP4K2AP48426 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms