Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms