Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP2K4P45985 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms