Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX19P40855 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX19P40855 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX19P40855 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX19P40855 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX19P40855 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX19P40855 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX19P40855 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX19P40855 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX19P40855 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX19P40855 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX19P40855 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX19P40855 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX19P40855 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX19P40855 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX19P40855 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX19P40855 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms