Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX1P40424 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX1P40424 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX1P40424 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX1P40424 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX1P40424 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX1P40424 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX1P40424 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX1P40424 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX1P40424 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX1P40424 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBX1P40424 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBX1P40424 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX1P40424 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX1P40424 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX1P40424 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PBX1P40424 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PBX1P40424 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX1P40424 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX1P40424 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX1P40424 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX1P40424 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX1P40424 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PBX1P40424 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PBX1P40424 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms