Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTRLP40313 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTRLP40313 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTRLP40313 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTRLP40313 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTRLP40313 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTRLP40313 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTRLP40313 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTRLP40313 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms