Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFI27P40305 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFI27P40305 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFI27P40305 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFI27P40305 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFI27P40305 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFI27P40305 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFI27P40305 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IFI27P40305 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFI27P40305 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFI27P40305 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFI27P40305 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms