Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPGP40121 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPGP40121 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPGP40121 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPGP40121 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPGP40121 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPGP40121 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPGP40121 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPGP40121 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPGP40121 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPGP40121 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPGP40121 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPGP40121 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPGP40121 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPGP40121 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPGP40121 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms