Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNN1AP37088 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCNN1AP37088 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1AP37088 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms