Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBRP36941 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBRP36941 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBRP36941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBRP36941 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBRP36941 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBRP36941 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBRP36941 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBRP36941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBRP36941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBRP36941 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBRP36941 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBRP36941 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBRP36941 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBRP36941 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBRP36941 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBRP36941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBRP36941 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBRP36941 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBRP36941 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBRP36941 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBRP36941 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBRP36941 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBRP36941 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms