Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFTPDP35247 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms