Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMI1P35226 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMI1P35226 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMI1P35226 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMI1P35226 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMI1P35226 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMI1P35226 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMI1P35226 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMI1P35226 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms