Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA4P34932 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA4P34932 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA4P34932 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HSPA4P34932 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HSPA4P34932 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA4P34932 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA4P34932 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA4P34932 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA4P34932 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA4P34932 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA4P34932 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA4P34932 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA4P34932 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA4P34932 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA4P34932 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA4P34932 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms