Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 RSC30YHR056C 2652 nt5.45□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 PMT2YAL023C 2280 nt5.45□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 TAH18YPR048W 1872 nt5.45□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ARH1YDR376W 1482 nt5.45□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 YLH47YPR125W 1365 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 BRL1YHR036W 1416 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ISY1YJR050W 708 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SPC42YKL042W 1092 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 RER2YBR002C 861 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SIP5YMR140W 1470 nt5.44□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 CTS1YLR286C 1689 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 RRN3YKL125W 1884 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 COQ6YGR255C 1440 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 UPS3YDR185C 540 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 RPT6YGL048C 1218 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SPO12YHR152W 522 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 YKL151CYKL151C 1014 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 GAL10YBR019C 2100 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 NAT5YOR253W 531 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 DSE3YOR264W 1293 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 COX11YPL132W 903 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 VBA1YMR088C 1689 nt5.43□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ECM3YOR092W 1842 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ARP2YDL029W 1176 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ERD1YDR414C 1089 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SLO1YER180C-A 258 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SUA5YGL169W 1281 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SYN8YAL014C 768 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 CBF1YJR060W 1056 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 XPT1YJR133W 630 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 SPC97YHR172W 2472 nt5.42□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 AVT3YKL146W 2079 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 DBF4YDR052C 2115 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 MMR1YLR190W 1476 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 PRO3YER023W 861 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 IRC7YFR055W 1023 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 PML1YLR016C 615 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 MTF1YMR228W 1026 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 YBL081WYBL081W 1107 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ISU2YOR226C 471 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 MMP1YLL061W 1752 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 EIS1YMR031C 2532 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 LPL1YOR059C 1353 nt5.41□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 YDR132CYDR132C 1488 nt5.4□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 RAM1YDL090C 1296 nt5.4□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 PIC2YER053C 903 nt5.4□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 VAM7YGL212W 951 nt5.4□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 GTO1YGR154C 1071 nt5.4□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 POM33YLL023C 840 nt5.4□□□□□ -1.54
YBL055CP34220 ERG7YHR072W 2196 nt5.4□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 WTM1YOR230W 1314 nt5.4□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 URA7YBL039C 1740 nt5.4□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 NOT3YIL038C 2511 nt5.39□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PDI1YCL043C 1569 nt5.39□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PCL6YER059W 1263 nt5.39□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 NAG1YGR031C-A 492 nt5.39□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 YOR318CYOR318C 306 nt5.39□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 CTS2YDR371W 1536 nt5.38□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 SRV2YNL138W 1581 nt5.38□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PUS1YPL212C 1635 nt5.38□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 MMS2YGL087C 414 nt5.38□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 NPT1YOR209C 1290 nt5.38□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 GRS1YBR121C 2004 nt5.38□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 OCA5YHL029C 2040 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 MRPL25YGR076C 474 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PRP45YAL032C 1140 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 snR10snR10 245 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 CUE2YKL090W 1332 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 RSM23YGL129C 1353 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PRR1YKL116C 1557 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 ARB1YER036C 1833 nt5.37□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 YAP1YML007W 1953 nt5.36□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 KTI12YKL110C 942 nt5.36□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 CTR3YLR411W 726 nt5.36□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 DCI1YOR180C 816 nt5.36□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PCL10YGL134W 1302 nt5.36□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 VPS1YKR001C 2115 nt5.35□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 KNH1YDL049C 807 nt5.35□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 IPK1YDR315C 846 nt5.35□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 YKL107WYKL107W 930 nt5.35□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 ETR1YBR026C 1143 nt5.35□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 FHL1YPR104C 2811 nt5.35□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 APM2YHL019C 1818 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 THI21YPL258C 1656 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 GET3YDL100C 1065 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 YER187WYER187W 426 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 MLC1YGL106W 450 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 PDE1YGL248W 1110 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 AIM41YOR215C 558 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 CAR1YPL111W 1002 nt5.34□□□□□ -1.55
YBL055CP34220 SED4YCR067C 3198 nt5.34□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 SOG2YOR353C 2376 nt5.34□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 TEA1YOR337W 2280 nt5.34□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 APJ1YNL077W 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 ADE4YMR300C 1533 nt5.33□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 MCH4YOL119C 1506 nt5.33□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 SVF1YDR346C 1446 nt5.33□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 SPO77YLR341W 1434 nt5.33□□□□□ -1.56
YBL055CP34220 THP1YOL072W 1368 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms