Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms