Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC27P30260 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC27P30260 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC27P30260 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC27P30260 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC27P30260 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC27P30260 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC27P30260 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC27P30260 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC27P30260 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC27P30260 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC27P30260 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC27P30260 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC27P30260 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC27P30260 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC27P30260 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC27P30260 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC27P30260 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC27P30260 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC27P30260 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC27P30260 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC27P30260 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC27P30260 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC27P30260 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC27P30260 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms