Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK1P30085 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms