Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHATP28329 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHATP28329 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHATP28329 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHATP28329 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHATP28329 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHATP28329 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHATP28329 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHATP28329 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHATP28329 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHATP28329 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHATP28329 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHATP28329 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHATP28329 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHATP28329 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHATP28329 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHATP28329 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHATP28329 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHATP28329 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHATP28329 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHATP28329 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHATP28329 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHATP28329 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHATP28329 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHATP28329 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHATP28329 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHATP28329 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHATP28329 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHATP28329 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms