Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTFRP26992 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFRP26992 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms