Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VARSP26640 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VARSP26640 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VARSP26640 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VARSP26640 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VARSP26640 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VARSP26640 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VARSP26640 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VARSP26640 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VARSP26640 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VARSP26640 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms