Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA3P25788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms