Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCHP24723 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms