Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GADD45AP24522 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GADD45AP24522 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GADD45AP24522 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GADD45AP24522 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GADD45AP24522 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GADD45AP24522 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GADD45AP24522 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GADD45AP24522 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms