Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR1P24390 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms