Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRGP23470 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRGP23470 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRGP23470 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
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