Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGA6P23229 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA6P23229 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA6P23229 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms