Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACO1P21399 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACO1P21399 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACO1P21399 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACO1P21399 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACO1P21399 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACO1P21399 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACO1P21399 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACO1P21399 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACO1P21399 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACO1P21399 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACO1P21399 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACO1P21399 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACO1P21399 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACO1P21399 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACO1P21399 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACO1P21399 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACO1P21399 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACO1P21399 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACO1P21399 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACO1P21399 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACO1P21399 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACO1P21399 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACO1P21399 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms