Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK11BP21127 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms