Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms