Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms