Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms