Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMY2BP19961 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMY2BP19961 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms