Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM21P19474 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM21P19474 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms