Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6P18850 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6P18850 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6P18850 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6P18850 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6P18850 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6P18850 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6P18850 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6P18850 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6P18850 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6P18850 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF6P18850 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6P18850 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6P18850 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6P18850 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6P18850 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6P18850 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6P18850 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF6P18850 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF6P18850 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF6P18850 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6P18850 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6P18850 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6P18850 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6P18850 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6P18850 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6P18850 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6P18850 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6P18850 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6P18850 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6P18850 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6P18850 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6P18850 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF6P18850 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF6P18850 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF6P18850 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF6P18850 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF6P18850 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms